Os representantes baianos na Copa do Brasil, Bahia, Vitória e Vitória da Conquista, conheceram seus adversários na primeira fase da competição. A competição começa dia 3 de abril, porém os locais dos jogos de ida ainda não foram definidos.
O Bahia, campeão baiano de 2012, vai encarar na primeira fase da Copa do Brasil o MAC (Maranhão Atlético Clube), já o Vitória, vice-campeão de 2012, vai duelar na fase inicial da Copa do Brasil com o Mixto (MT).
O Vitória da Conquista, que garantiu vaga na Copa do Brasil devido ao título da Copa Governador do Estado, irá estrear na competição de mata-mata o Sport, que foi vice-campeão pernambucano.
Caso se classifiquem: Bahia pega Luverdense (MT) ou Tupi (MG), Vitoria encara Boa ou Salgueiro e o Conquista enfrenta ABC ou Parnahyba (PI)
O Grêmio, Fluminense, Corinthians, Atlético Mineiro e Palmeiras, que disputam a Libertadores, entram na Copa do Brasil somente nas oitavas de Final.
A novidade da competição é o número de participantes, 80 clubes, e o período que irá ocorrer, entre 3 de abril e 27 de novembro, data da final.